まずは第8章用のフォルダを作成し(たとえば、chapter08)、以下のファイルをダウンロードしよう
metadata_ecopl.obj
phyto_metadata.obj
phyto_ryuko_data.obj
summary_ecopl.obj
以下のRスクリプトファイル(およびHTMLファイル)上のコードでは主成分分析の一部のコードがveganパッケージのアップデートにより動きません。 訂正と補足の中頃の「・主成分分析・主座標分析におけるspecies scoreと寄与率の表示について」の解説をご確認ください。
chapter08の直下にサンプルRスクリプトをダウンロードしよう
multivariate_plot.R
このRスクリプトの日本語解説込みのHTMLファイルは、次のリンクをクリックすればそのままウェブブラウザの新規タブで表示されます(Edgeを推奨、Safariも可):
multivariate_plot.nb.html